嗜热菌蛋白酶是一种生物学上的物质，外文名是Thermolysin。特性是水解疏水性强的氨基酸时速度较快。
水解肽链上L-苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、甲硫氨酸（蛋氨酸）的N端。水解亮氨酸、异亮氨酸、甲硫氨酸（蛋氨酸）以及其他疏水性强的氨基酸时速度较快。
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